1399年(建文元年)，朱棣率大军南下，以“清君侧”的名义向南京发兵，史称“靖难之役”，建文帝虽然手握重兵，最终还是没能抵抗住燕王，仅不到四年的时间，朱棣就攻下了南京城，建文帝则在战乱中下落不明，有人说他死于大火，但一直没能找到尸首，也有人猜测，建文帝在南京城破之时已经秘密逃走，至于逃到哪里，几百年来无人知晓。
建文帝在战乱中逃走，并非空穴来风，朱棣对此当然有所耳闻，而且深感不安，因为他获取帝位名不正言不顺，倘若朱允炆还在世，对他来说就一直是个威胁，所以一直没有停下搜寻的行动，但多年未有所获，于是不惜扩大搜寻范围，甚至找打了海外，有人说朱棣派郑和下西洋有一个不可告人的秘密，就是为了寻找建文帝的下落。
朱棣如此兴师动众，终其一生都没有找到任何的蛛丝马迹，关于建文帝下落之谜，历代明朝皇室都很关心，在《明实录》里有这样一段记载，一天万历皇帝和内阁首辅张居正对话，万历皇帝问：闻建文当时逃逸，果否？张居正回答：国史不载此事，但先朝故老相传，言建文帝当靖难师入城，即削发披缁，后云游四方，无人能知者。
建文帝下落几百年来一直没有定论，《明史》中都没有关于他的记载，因为朱棣不承认建文帝，说建文帝出逃都是凭空猜测，并没有找到证据，近年来，关于建文帝下落之谜，有了一个实质性的进展，福建宁德市上金贝村的一座百年古墓吸引了专家们的注意，有专家不远千里来到此处，看完之后直接给出了肯定的说法，认为此处就是建文帝朱允炆的墓地。
给出这个结论的有两个代表人物，一个是当年南京大学历史系教授、著名明史潘群，另一位是明史学者马渭源，当时前去考察的并非他们两个人，而是组成了一支明史研究专家组，不过他们二人提出的结论，得到了专家组的一致认可，依据就是他们提出的四点证据，我们不妨列举出来，大家看看是否有说服力。
专家给出的第一个理由：墓地规格及形式。此墓上方有火龙珠，这是典型的明代墓葬特点，而且流行于明永乐朝以前，再从墓地的规模来看，当地传说这个墓地里埋葬着一位和尚，而一个普通和尚的墓地是不可能有这么大的规模，此外，此墓还用了闭嘴龙的纹饰，在明朝前期，只有皇帝才能使用龙纹饰，普通人不敢用，用就犯死罪。
专家给出的第二个理由：墓碑上并没有任何文字。专家发现墓碑上并没有任何文字，也没有年代记载，这在一个普通大墓上也是不可能出现，专家推断可能是建文帝被燕王朱棣赶下皇位后，他也不承认朱棣的帝位，所以也不使用“永乐”纪年，而且建文帝是亡命天涯，也不敢写上自己的名字，所以最后干脆一个字也不留在墓碑上。
专家给出的第三个理由：明代龙饰袈裟。在这个墓的旁边有一座古寺，寺中保留着一件明代的袈裟，袈裟上部绣有九条金龙，袈裟中间还绣有五条金龙，这就是“九五之尊”的意思，是只有皇帝才敢如此表示，对于此，专家解释，建文帝当年出逃时就是假扮和尚，当时他并没有准备袈裟，只能临时把祖父朱元璋的袈裟拿来用，因为朱元璋做过和尚，当上皇帝后就做了这么一件“九五之尊”袈裟。
专家给出的第四个理由：郑三合与郑洽。据上金贝村的族谱记载，他们的祖先在明朝时期就来到此处，祖上名叫郑三合，专家通过查阅史料发现，当年跟随建文帝一起出逃的大臣中，刚好有一位叫郑洽，郑洽跟随建文帝逃到福建后，也不敢暴露自己的身份，于是就开始隐姓埋名，把名字改成了郑三合，而三合二字就是把洽字拆分开。
专家虽然给出了意见，甚至愿意“用一辈子的名誉担保”，但此墓至今没有发掘，因为根据相关规定，只有当古墓被破坏后，才能进行抢救性发掘，至于此墓到底是不是建文帝葬身之处，只有考古发掘后才能知道答案，不过还是希望此墓永远都不要被发掘，因为不发掘就代表保存完整完好、没有被破坏，也没必要因为人的好奇心而动土。
